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案例分享|东纳生物核酸提取磁珠在血浆游离DNA分离中的应用

日期: 2022-07-26
浏览次数: 44

案例分享|东纳生物核酸提取磁珠在血浆游离DNA分离中的应用











好磁珠 , 东纳造

www.nanoeast.net









1


游离DNA的来源

游离DNA(Circulating free DNA,cfDNA),循环游离DNA,是释放到血浆中的降解的DNA片段。cfDNA存在于人体的各种体液中,随组织损伤、癌症和炎症反应等发生浓度变化。正常人体的cfDNA主要通过细胞凋亡过程中产生的长度约为166bp的小片段DNA。而在有严重器官损伤的人体中,会产生大量的死亡细胞,这时就会释放相对正常水平更多的cfDNA。


游离DNA提取难点

cfDNA检测是目前市场上最常见的液体活检形式,在疾病诊断和检测方面存在着巨大的潜力。虽然cfDNA的应用范围较广,但因其在血液中含量较低、样本采集和保存等因素的影响,导致cfDNA的提取并非易事,最常见的就是提取得率低。因此,如何提高cfDNA的得率就变得非常重要。

案例分享

东纳磁珠客户应用案例1:

实验目的:测试东纳磁珠在提取血浆中游离DNA的效果

试用磁珠:东纳1μm硅羟基磁珠,批号:MBSi20210623-ZW-A

实验方法:按照客户游离DNA提取试剂盒操作流程,搭配东纳磁珠,分别采用全自动核酸提取仪和手动提取血浆游离DNA,并与进口血浆游离DNA提取试剂盒(磁珠法)对比。取2μL洗脱液进行QubitTM dsDNA HS Assay Kit定量和qPCR检测。

实验结果:Qubit和qPCR检测结果表明:东纳磁珠在全自动核酸提取仪和手动提取cfDNA表现都很优异,能达到进口磁珠的提取效果。


表1. 提取血浆游离DNA的结果

样本

提取方法

磁珠

CT

Qubitng/μL

V ( μL)

Total (ng)

 

全自动核酸提取

进口磁珠

29.05

0.0336

40

1.344

29.02

东纳磁珠

28.68

0.0644

40

2.576

28.48

 

手动提取

进口磁珠

28.17

0.0656

40

2.624

28.08

东纳磁珠

28.92

0.0852

40

3.408

28.63



东纳磁珠客户应用案例2:

实验条件:使用东纳磁珠和竞品磁珠,相同磁珠用量的情况下对200 μL血浆进行提取,洗脱体积为50 μL。取2 uL洗脱液进行QubitTM dsDNA HS Assay Kit定量检测。

实验结果:提取相同体积的血浆,东纳磁珠比竞品磁珠提取的游离DNA得率高。


表2. 提取200ul血浆游离DNA产量

案例分享|东纳生物核酸提取磁珠在血浆游离DNA分离中的应用












东 纳 生 物 明 星 产 品

1 μ m 硅 羟 基 磁 珠









1
1
产品优势


1. 产品粒径均匀一致,可获得良好的重现性;

2. 超顺磁性,磁响应性时间短;

3. 可配合自动化仪器进行高通量操作,磁珠基本无残留。


2
磁珠技术参数


货号

MB1101

产品名称

1 μm硅羟基磁珠

磁含量

25%-35%

浓度

50 mg/mL

颜色

棕黑色

平均粒径

1 μm

保存溶液

纯水+0.02%防腐剂

用途

适用于游离DNA提取以及植物、质粒、土壤、血液、组织等样本的基因组提取



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